Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN3

Gm1979, Predicted gene 1979, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1979E9QAN3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1979E9QAN3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1979E9QAN3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms