Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmod3E9QA62 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms