Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cald1E9QA15 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms