Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms