Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Urb2E9Q7L1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms