Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

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Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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Usp31E9Q6Y8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Usp31E9Q6Y8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Usp31E9Q6Y8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp31E9Q6Y8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp31E9Q6Y8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp31E9Q6Y8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp31E9Q6Y8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Usp31E9Q6Y8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp31E9Q6Y8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Usp31E9Q6Y8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Usp31E9Q6Y8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp31E9Q6Y8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp31E9Q6Y8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp31E9Q6Y8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp31E9Q6Y8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp31E9Q6Y8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp31E9Q6Y8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp31E9Q6Y8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp31E9Q6Y8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp31E9Q6Y8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp31E9Q6Y8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp31E9Q6Y8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp31E9Q6Y8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp31E9Q6Y8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp31E9Q6Y8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms