Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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