Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms