Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fndc1E9Q043 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms