Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms