Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms