Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms