Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
3425401B19RikD3Z1D3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms