Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf217D3YYI7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf217D3YYI7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf217D3YYI7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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