Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms