Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms