Protein–RNA interactions for Protein: B9EJV3

Greb1l, GREB1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1lB9EJV3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Greb1lB9EJV3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Greb1lB9EJV3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Greb1lB9EJV3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1lB9EJV3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1lB9EJV3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1lB9EJV3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1lB9EJV3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1lB9EJV3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1lB9EJV3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1lB9EJV3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1lB9EJV3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1lB9EJV3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1lB9EJV3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1lB9EJV3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1lB9EJV3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1lB9EJV3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1lB9EJV3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1lB9EJV3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1lB9EJV3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1lB9EJV3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1lB9EJV3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1lB9EJV3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1lB9EJV3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1lB9EJV3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms