Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cped1B2RX70 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms