Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms