Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms