Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ythdc2B2RR83 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ythdc2B2RR83 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms