Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1B2KF50 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms