Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms