Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms