Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spocd1B1ASB6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms