Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms