Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prr29B1ARI9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prr29B1ARI9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prr29B1ARI9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prr29B1ARI9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prr29B1ARI9 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prr29B1ARI9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms