Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms