Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CatsperbA2RTF1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CatsperbA2RTF1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms