Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samt1A2BED8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samt1A2BED8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 812.2 ms