Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf2A2AT37 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms