Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef17A2ASJ1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms