Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scn3aA2ASI5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms