Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms