Protein–RNA interactions for Protein: A2AKE5

1700003F12Rik, RIKEN cDNA 1700003F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700003F12RikA2AKE5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
1700003F12RikA2AKE5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700003F12RikA2AKE5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700003F12RikA2AKE5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700003F12RikA2AKE5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700003F12RikA2AKE5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700003F12RikA2AKE5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700003F12RikA2AKE5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700003F12RikA2AKE5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1700003F12RikA2AKE5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700003F12RikA2AKE5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700003F12RikA2AKE5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700003F12RikA2AKE5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700003F12RikA2AKE5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700003F12RikA2AKE5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700003F12RikA2AKE5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms