Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc183A2AJB1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc183A2AJB1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc183A2AJB1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc183A2AJB1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc183A2AJB1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc183A2AJB1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc183A2AJB1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc183A2AJB1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms