Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp8nlA2ABX0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms