Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms