Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm16A2A935 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms