Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl2cA2A6C4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms