Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav12-2A0N8N6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms