Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms