Protein–RNA interactions for Protein: A0A1L1SUT5

4930563M21Rik, RIKEN cDNA 4930563M21 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms