Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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Hdac6Q9Z2V5 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Hdac6Q9Z2V5 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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Hdac6Q9Z2V5 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Hdac6Q9Z2V5 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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Hdac6Q9Z2V5 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Hdac6Q9Z2V5 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Hdac6Q9Z2V5 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Hdac6Q9Z2V5 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Hdac6Q9Z2V5 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Hdac6Q9Z2V5 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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