Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SgshQ9EQ08 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms