Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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