Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Apobec3Q99J72 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms