Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp4Q921I6 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms