Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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Usp38Q8BW70 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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Usp38Q8BW70 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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Usp38Q8BW70 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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Usp38Q8BW70 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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