Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
NischQ80TM9 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NischQ80TM9 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms